2008年1月6日，厦深铁路广东段开工建设，线路途经惠东县设站。2010年，惠东站开始进入前期规划阶段，时称惠州东站。2012年，惠东站开始进入施工建设阶段。2013年12月28日，惠东站随厦深铁路同时开通运营。2014年12月30日，惠东站站场市政配套工程完工并投入使用。2019年12月10日，惠东站启用电子客票。惠东站是一座地面铁路车站，共有两层；站内旅客乘降组织采用下进下出的流线形式，地下进出通道合二为一。车站一层为站厅层，西部为出站口、中部为进站口、东部为售票厅；车站二层为候车室，楼面与高铁轨道平行。站前广场位于站房南面，轨道站台位于站房北面；广场两侧分设出租车场和公交车站。