2010年7月，《新建杭州至黄山铁路项目建议书》通过中华人民共和国发展和改革委员会批复，线路途经建德设站。2014年1月，《杭州至黄山铁路可行性研究报告》经过中华人民共和国发展和改革委员会批准，线路途经建德设建德东站。2016年10月，车站开工建设，初期定名为建德东站。2018年3月，《新建杭衢铁路（建衢段）先期工程环境影响评价》第二次公示，规划建设建德站杭衢场。11月，《杭州至衢州铁路建德至衢州段项目可行性研究报告》获批，途经建德站。12月25日，伴随着杭黄高速铁路开通运营，建德站投入使用。2019年4月，建德站杭衢场开工建设。2019年11月12日起，建德站将启用电子客票，“取票”这一环节将成为历史。建德站分成地上高架层和地下平面层。车站的西侧一楼是出站口，出站口正对面有一座“建德旅游服务中心”，为游客提供旅游咨询、票务办理和租车服务。出站口右拐是很大的一个露天接驳广场，设有公交车、出租车等待区；车站东面的室外广场设有私家车停车场。