1931年，金华站始建。1932年2月15日，正式通车开站。1941年1月至5月，金华站遭受了日本侵略者的多次轰炸，站长室、货房和7条站线被毁。1942金华沦陷后，侵华日军为了军列和运送武义的砩矿石，修复了线路和车站。1947年4月，金华站修复重新通车。1958年，隶属于京沪杭甬铁路管理局的金华站正式更名为金华中心站。1996年1月，客运业务移到新建的金华火车西站。1997年4月，金华东站承担了金华站的列车编解任务。1999年12月，车站东西两端老线拆除后，老站成为一个单纯的货场，主要功能转为金华站部分货物装卸、机动机车车厢存放和机车掉头及维修保养之用，原来的候车室、售票处对外出租。2009年，金华老铁路货场迁建工作正式启动。2014年10月20日，金华西站更名为金华站，原金华站则更名为金华西站；同年12月10日，沪昆高铁杭州至南昌段开通，金华正式进入高铁时代；同日，金华站北站房及广场开通。2017年3月，金华站南站房拆除重建；3月1日，金华站普铁停运，进行高架候车室、站台、旅客地道等设施的改造。2018年12月28日，金华站南站房启用试运行。2019年1月5日，金华站全面恢复普速列车办客；同年8月22日，金华站增设自助实名制核验闸机5台。