2014年7月，进贤南站站房主体工程完工；11月，进贤南站站房进出站用的相关设备基本安装到位；12月，进贤南站开通运营。2020年2月，防控新冠肺炎疫情期间，志愿者们对进出进贤南站的旅客测体温、个人信息登记、数据整理、上报疫情防控指挥部等一系列工作。进贤南站站房为线侧平式，钢筋混凝土框架结构形式；建筑面积为6000平方米，最多可同时容纳860人；站前广场总面积26000平方米，站房主体建筑外墙，南北面宽112.6米，东西进深36.9米，站房主体最高点距站台面15米，新建8米宽旅客进出站地道1座，基本站台、中间站台均设450米长双向悬挑有柱雨棚，雨棚面积8134平方米。