普宁站为线侧下式车站，正线及到发线7条，设站台三座(包括基本站台、二站台、货物站台各1座)，站房总建筑面积达6000平方米，将建成集铁路、长途客运、公交、的士换乘于一体，客运站、东方翡翠大酒店、文化广场、康美（普宁）中药城的东部新城起步区。普宁高铁站周边配套工程总投资1.7亿元，项目包括城南客运站、站前大小广场、进站道路和治安监控系统等基础设施，届时，将实现高铁、公交、的士、客运班车的零换乘。2014年，普宁站共发送旅客140多万人次，日均发送旅客4000多人次；2017年春运期间，普宁站每天进出旅客约为2.1万。