普者黑站是云桂铁路州级中心站和滇东南片区唯一设置的客运综合站，也是师宗经丘北至河口和天保两个国家级口岸的铁路中心站，是建设云南省连接北部湾、珠三角地区的重要物流枢纽。普者黑站建筑规模为中型旅客车站，站房由二层构成，一层为候车厅、售票厅、出站厅、部分设备用房，二层为办公用房、旅客服务等；中间区域候车大厅为一层。截至2016年12月，普者黑站场按3站台8线布置（含2条正线），一座基本站台，共5站台面，途经的线路为南昆高速铁路  。截至2016年12月，普者黑站的站房总面积为7948平方米，车站旅客设计最高聚集人数为988人。