2002年10月，《漳潮铁路预可行性研究报告》完成编制，拟建漳州至潮州铁路，途经潮州市设站。2004年7月，中国沿海铁路规划出炉，漳潮铁路纳入沿海铁路厦深段，途经潮州市设站。2005年4月，厦深铁路线路规划确定，途经潮州市设饶平站。2008年1月15日，厦深铁路广东段开工建设，规划饶平站为沿途车站。2013年12月，厦深铁路竣工通车，饶平站投入使用。2015年11月1日，饶平站新候车综合大楼开始扩建。2017年春运，饶平站新候车综合大楼投入使用。2018年8月，饶平站站前广场改造开工建设。2019年12月10日，饶平站实施电子客票。饶平站整个站台采用无廊柱钢结构，并配有自动扶梯方便旅客进出站台；饶平站配套有双向四车道的进站大道，配有公交站、汽车客运站、的士停车点和公共临时停车场；站区自西向东分别为出站口、进站口和售票处，进站口处，两台安检，三个旅客入闸口处都设置有刷卡机器，旅客乘动车可刷车票或身份证入站。