2016年5月13日，正式启用新站房。2017年6月18日，站前广场正式启用。2019年11月26日，如皋站启用电子客票。2020年6月20日起，如皋站全面实施电子客票。2020年7月1日沪苏通铁路跟沪苏通长江大桥将正式通车，宁启铁路与沪苏通铁路贯通运营。此次铁路调图如皋站的通达能力显著提升，停靠列车数量更多，增加了上海、杭州南、重庆北、亳州南、黄山北、深圳北等方向的旅客列车。下午14时46分，首列由扬州开往上海虹桥的C3751次动车准点停靠如皋火车站，如皋与上海终于通过高铁更加紧密的相连了！2020年7月2日11点20分，由黄山北开往扬州的G7580准点停靠如皋站1站台，如皋有铁路以来首次有G字头的高铁停靠。