瑞金站始建于2003年，于2005年4月完成建设并随赣瑞龙铁路的开通而正式投入运营 。2014年10月，瑞金站信号改造普速场开通  。2019年3月，瑞金站扩建工程开工。瑞金站总建筑面积为8535.8平方米，站台规模为3台7线。瑞金站扩建工程完工并投入运营。截至2020年1月，瑞金站站房主体为二层，局部三层。旅客进出站流线为“上进下出”，一层和二层都设有候车厅；瑞金站设有办公楼、贵宾楼、售票厅、消防控制室、客运综控室、信息机房等