2009年，鄯善北站开工建设。2014年10月，鄯善北站完成主体工程的建设，进入后期设备调试、站前广场及附属配套设施等的收尾阶段；10月10日，鄯善北站站前广场施工进入花坛边贴砖阶段；11月16日，随兰新高速铁路的开通而投入运营。2016年10月，鄯善北站开通高铁快运业务。2020年4月29日，鄯善北站开始实施电子客票。鄯善北站共四层，其中地上两层，地下两层。鄯善北站中间为候车大厅，售票厅设在候车大厅右侧，另设有一个进站口和一个出站口。鄯善北站的站台规模为2台4线，途经的线路为兰新高速铁路。鄯善北站实行有平安站车站、金盾护你行安全守卫工作，实行预约紧急服务，护送特殊旅客或有困难的群众出行。