武夷山站建于1997年。 原线路为横南铁路（浙赣线横峰站——外福线南平南站）。在中国铁路第六次大提速过程中，铁道部决定将部分铁路老线进行更名，并于2006年12月31日18时起实行统一贯通里程，横南铁路、外福铁路福州-南平南段正式更名为峰福铁路，原外福铁路南平南-外洋段改称外南铁路。