溆浦南站车站中心里程为(长昆段)DK273+050，站房设于线位北侧，站坪为平坡，本站设到发线2条，有效长650m;设450×9×1.25m侧式站台2座，在站中心处设旅客地道1座。车站站台部分位于高填方地段，设站台梁通过，站房为线下式。为满足检修需要，在小里程设保养点一处，设大型养路机械停留线1条，确认车停留线1条。车站两端咽喉区各设1组渡线组成"八字"渡线。溆浦南站地形地势比较复杂，起伏较大，车站750米在高架桥上，500米在路基上，250米进入隧道内。溆浦南站的正式建成通车，标志着溆浦 “两高时代”的正式到来。