1956年，原玉门镇站成立。2013年11月，位于玉门东镇的原玉门站改名为玉门东站，位于玉门镇的原玉门镇站改名为玉门站。玉门站，离玉门南站32公里，离兰州站803公里，离乌西站1109公里。客运：办理旅客乘降；行李、包裹托运。货运：办理整车、零担货物发到；办理整车货物承运前保管；不办理罐装危险货物发到；不办理整车爆炸品及整车一级氧化剂发到。