株洲南站为地面站，站房设计为三层，其中，地下一层，地上两层，总建筑面积2500平方米。地下层主要担当乘客进出站通道功能；地上一层为站厅层，设有售票处和候车区；地上二层为车站工作区。2016年12月26日，长株潭城际铁路正式通车。2020年2月26日，为顺利实施株洲火车站改扩建工程，经株洲市人民政府与中国铁路广州局集团有限公司协商，长株潭城际铁路株洲南站预计停运10个月，预计车站停办至2020年12月26日。