2009年12月，巴中站开工建设。2011年12月16日，巴中站开始试运行，结束巴中市区不通火车的历史。2019年9月25日，巴中站开始经停动力集中复兴号动车组。巴中站南侧为售票厅、办公大楼，中间为候车厅，其中可通过地道可到其他站台，出站口设置与北侧。候车厅设有茶座，超市，网吧及ATM相关设施。候车厅右侧为咨询中心和办公大楼入口。巴中站设有4个人工售票窗口，长期运行，各个窗口和自动售票机均售60日以内车票。