2017年，丹江口站开工建设。车站原项目名称为丹江口南站。2019年9月，车站定名为丹江口站。2019年11月29日，丹江口站投入使用。2020年1月25日，因新型冠状病毒肺炎疫情，丹江口站关闭进站通道。同年3月28日，丹江口站恢复办理客运业务。丹江口站站房屋面采用弧形钢结构设计，造型为竖向生长的水坝， 立面竖向线条描绘出丹江水坝的剪影，带型采光侧窗为江水的造型抽象，展现了丹江口大坝的泄洪形式，体现了丹江口作为“中国水都”的地域文化特色。