高邮站具有方便高邮、兴化和江都北部等地群众出行功能，充分发挥该铁路对整个高邮地区的辐射拉动作用，使高邮迈入高铁时代。设计规模为2台4车道。届时开通高铁动车组，向南连接沪宁高铁到达南京、上海、苏锡常和镇江，向北连接京沪高铁、徐盐高铁到达北京、青岛、环渤海经济区。未来将通过连镇高铁二期南延工程(镇宣铁路)连接宁杭高铁到达杭州、宣城，未来与京福高铁连接，把高邮对外交通融入国家十三五浙皖赣铁路主干网。