2004年7月，中国沿海铁路规划出炉，原规划漳潮铁路纳入沿海铁路厦深段，途经汕尾市设站。2005年4月，厦深铁路线路规划确定，规划途经汕尾市海丰县设置站点 。2008年1月15日，厦深铁路广东段开工建设，规划鲘门站为沿途车站。2013年5月， 鲘门站站房主体完成87% 。2013年12月28日，厦深铁路竣工通车，鲘门站投入使用。2019年12月10日起，鲘门站实施电子客票。