林芝站是川藏铁路上的地市级车站，顾及尼洋河谷的林芝市区八一镇，同时考虑市区距离铁路主线所经过的雅鲁藏布江河道很远（直线距离25公里），因此，选址上采取了折中法，走中型∧字形路线进入尼洋河谷。另外，也兼顾巴宜区未来的南向发展，河谷地带的可用空间有限。铁路隧道在林芝镇通过大拐弯的展线方式两次穿越苯日神山，下降到尼洋河谷，顺利和林芝火车站对接。林芝站也是康林铁路段的终点站，由林芝镇转向林芝站。铁路隧道在林芝镇通过大拐弯的展线方式两次穿越苯日神山，下降到尼洋河谷的火车站。