2018年3月，南阳东站主站房开工建设。2019年6月18日，南阳东站的命名正式被中国铁路郑州局集团公司南阳车务段批复；7月15日，郑万高铁南阳站命名为“南阳东站”。2019年11月23日，南阳东站广场进行灯光测试；12月1日，南阳东站投入使用。截至2019年12月，南阳东站站房建筑面积50680平方米（含落客平台及匝道），雨棚14619平方米，生产生活房屋16148平方米，铁路自营停车场10000平方米，建筑高度24.4米，建筑总面积39916平方米。站房主体为钢筋混凝土框架结构，最高聚集人数3500人 。