全州南站车站站房建筑面积3193.32平方米，设基本站台和中间站台各一座，站房中部为旅客候车大厅，右侧设售票处，站房采用钢筋混凝土框架结构，主体一层。站房位于列车下行运行方向左侧，南北长90.2米，东西宽24米，总建筑规模达到842.4平方米。共有正线2条、到发线2条。2个站台，1站台与2站台地道相连。