如皋南站站场规模2台4线，站型为线侧平式站房，总建筑面积11997（不含架空层面积），架空层建筑面积6778。最高聚集人数800人，为中型旅客车站。采用上进下出（天桥进站，地道出站）的流线模式。建筑主体二层（局部四层），架空一层，站房总长度128.2m，最大进深46.2m，站房主体高度20.00m。