万州北站设计为跨线式高架站房，站房位于线路正上方。 车站总规模为3台7线，其中正线为2条，到发线为5条。另预留1台2线，暂不建设，站房主体为1层，两侧局部为2层。总建筑面积为2.5万平方米，分地下一层和地上一层、二层布局。南广场总用地面积34660平方米，总建筑面积47192平方米(地下两层、地上一层)。其中:出站换乘厅3772平方米，配套用房8593平方米，出租车等候区及广场下穿车道3102平方米，地下车库面积22376平方米，设备用房面积1974平方米，其他交通面积7375平方米;景观绿化面积5968平方米;停车位542个;配套完善给排水，电气，挡护，装修等附属设施建设。设有高铁动车所一座，占地280亩，是动车组存放、检查、临修、检测的场所，具备多趟高铁动车组始发条件，为今后增加高铁动车车次预留空间。